A Terceira Clínica Cirúrgica foi a primeira enfermaria que se transferiu da Santa Casa de Misericórdia de São Paulo para as novas instalações no Hospital das Clínicas. A mudança dos demais serviços foi feita paulatinamente, no período de 1944 a 1948, com a transferência do Serviço do Professor Alípio Corrêa Netto após a inauguração da ala de Clínica Cirúrgica.

 

Durante a sua existência foi dirigida pelos Professores Benedicto Montenegro, Eurico da Silva Bastos, Arrigo Raia, Mario Ramos de Oliveira, Dario Birolini e Samir Rasslan. No período de 1996 a 2004, o Professor Aldo Junqueira Rodrigues Junior foi responsável pelo Serviço de Cirurgia Eletiva e pela Disciplina de Cirurgia Geral da FMUSP.

     

Atualmente denominada Divisão de Clínica Cirúrgica III, engloba os Serviços de Cirurgia Geral Eletiva e de Cirurgia de Emergência, com leitos distribuídos no terceiro e oitavo andares do Instituto Central, além dos leitos do Pronto Socorro Central e a Unidade de Terapia Intensiva  de Emergência Cirúrgica, UTI do Trauma, localizada no quarto andar.